Ендометриозата е нодуларна, фокална и дифузна, тя засяга вагината, яйчниците, фалопиевите тръби и някои части на коремната кухина.
На жени с ендометриоза на яйчниците, които са подложени на каквато и да е операция, се препоръчва отстраняване на част от кората (на яйчниците), която съдържа яйцеклетки. Парчетата, които се изваждат, се замразяват и могат да се съхраняват няколко години. Ако жената с ендометриоза няма поколение до настъпването на менопаузата, чрез лапароскопия тя може да имплантира повторно замразените части и да постигне бременност.